Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSPC1Q8WXF1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSPC1Q8WXF1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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