Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZCCHC13Q8WW36 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZCCHC13Q8WW36 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms