Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBLCP1Q8WVY7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms