Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2AF1L4Q8WU68 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms