Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPPL3Q8TCT6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms