Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYRIPQ8NFW9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYRIPQ8NFW9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms