Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP18Q8NEJ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DUSP18Q8NEJ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DUSP18Q8NEJ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP18Q8NEJ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP18Q8NEJ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP18Q8NEJ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms