Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRF1Q8ND25 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRF1Q8ND25 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms