Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms