Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC38A9Q8NBW4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms