Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms