Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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FAM71DQ8N9W8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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FAM71DQ8N9W8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71DQ8N9W8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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FAM71DQ8N9W8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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FAM71DQ8N9W8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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FAM71DQ8N9W8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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FAM71DQ8N9W8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71DQ8N9W8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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