Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TC2NQ8N9U0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TC2NQ8N9U0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms