Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBL4BQ8N7F7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL4BQ8N7F7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms