Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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HDDC3Q8N4P3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDDC3Q8N4P3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDDC3Q8N4P3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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