Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL3Q8IZI9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNL3Q8IZI9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms