Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
P3H3Q8IVL6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
P3H3Q8IVL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms