Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms