Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRX1Q86UT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRX1Q86UT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms