Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
HECW1Q76N89 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HECW1Q76N89 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HECW1Q76N89 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms