Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PAXIP1Q6ZW49 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PAXIP1Q6ZW49 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms