Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms