Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C16orf54Q6UWD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms