Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC4Q6S5L8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHC4Q6S5L8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms