Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF7Q6Q0C0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms