Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL54Q6P161 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms