Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms