Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD16Q68DU8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms