Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM236Q5W0B7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM236Q5W0B7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms