Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM46CQ5VWP2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46CQ5VWP2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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