Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms