Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms