Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOGA3Q5TF21 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOGA3Q5TF21 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOGA3Q5TF21 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms