Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAX1Q5SQQ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms