Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms