Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4orf17Q53FE4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf17Q53FE4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms