Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN2Q52LD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN2Q52LD8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms