Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC38Q502W7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms