Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms