Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms