Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM71Q2Q1W2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM71Q2Q1W2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms