Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf58Q2M2W7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms