Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ISXQ2M1V0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISXQ2M1V0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISXQ2M1V0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ISXQ2M1V0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISXQ2M1V0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISXQ2M1V0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISXQ2M1V0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISXQ2M1V0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ISXQ2M1V0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms