Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms