Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPP1Q16831 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPP1Q16831 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms