Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCK2Q16822 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCK2Q16822 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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