Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2SQ16763 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2SQ16763 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms