Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRADDQ15628 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRADDQ15628 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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