Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDCD1Q15116 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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