Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIXQ14938 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIXQ14938 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms